Cục Thuế đang triển khai sắp xếp lại bộ máy ngành Thuế. Quá trình này gặp nhiều khó khăn về quản lý thuế, nhân sự, công nghệ thông tin và cơ sở vật chất. Song, với sự hợp tác và đồng lòng của hệ thống chính trị và công chức ngành Thuế, hoạt động được đảm bảo không gián đoạn. Cục Thuế đã chỉ đạo sắp xếp tinh gọn bộ máy nhưng vẫn giữ nguyên trách nhiệm và chất lượng phục vụ, đào tạo, bồi dưỡng nhân sự cho phù hợp với vị trí việc làm mới.
Cục Thuế hướng dẫn xử lý vấn đề liên quan đến sắp xếp tổ chức bộ máy nhà nước trong lĩnh vực quản lý thuế từ 01/7/2025, bao gồm phân định thẩm quyền UBND cấp xã và quy định phân quyền, phân cấp trong quản lý thuế.
Từ 1/7/2025, Cục Thuế thay đổi tên gọi cơ quan thuế và chức danh người có thẩm quyền. “Chi cục Thuế khu vực” đổi thành “Thuế tỉnh, thành phố”, “Đội Thuế cấp huyện” đổi thành “Thuế cơ sở”. Chức danh cũng thay đổi, ví dụ “Chi cục trưởng Chi cục Thuế khu vực” đổi thành “Trưởng Thuế tỉnh, thành phố”.